Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q5

Clic1, Chloride intracellular channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic1Q9Z1Q5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clic1Q9Z1Q5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms