Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1D9

Znf394, Zinc finger protein 394, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf394Q9Z1D9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf394Q9Z1D9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms