Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Phf1Q9Z1B8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf1Q9Z1B8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms