Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne6Q9Z140 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne6Q9Z140 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms