Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NgfrQ9Z0W1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms