Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb6Q9Z0T9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb6Q9Z0T9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms