Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cldn13Q9Z0S4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cldn13Q9Z0S4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cldn13Q9Z0S4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cldn13Q9Z0S4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Cldn13Q9Z0S4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Cldn13Q9Z0S4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Cldn13Q9Z0S4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Cldn13Q9Z0S4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Cldn13Q9Z0S4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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