Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms