Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Snx1Q9WV80 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx1Q9WV80 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms