Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms