Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV18

Gabbr1, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabbr1Q9WV18 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabbr1Q9WV18 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gabbr1Q9WV18 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gabbr1Q9WV18 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gabbr1Q9WV18 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gabbr1Q9WV18 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gabbr1Q9WV18 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gabbr1Q9WV18 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gabbr1Q9WV18 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabbr1Q9WV18 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabbr1Q9WV18 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabbr1Q9WV18 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabbr1Q9WV18 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabbr1Q9WV18 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabbr1Q9WV18 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabbr1Q9WV18 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabbr1Q9WV18 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabbr1Q9WV18 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabbr1Q9WV18 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabbr1Q9WV18 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabbr1Q9WV18 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabbr1Q9WV18 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabbr1Q9WV18 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabbr1Q9WV18 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabbr1Q9WV18 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabbr1Q9WV18 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabbr1Q9WV18 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabbr1Q9WV18 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabbr1Q9WV18 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabbr1Q9WV18 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabbr1Q9WV18 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabbr1Q9WV18 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms