Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx9Q9WUH2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx9Q9WUH2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms