Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkraQ9WTX2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms