Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR0

Mmp16, Matrix metalloproteinase-16, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp16Q9WTR0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp16Q9WTR0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp16Q9WTR0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp16Q9WTR0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp16Q9WTR0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp16Q9WTR0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp16Q9WTR0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp16Q9WTR0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp16Q9WTR0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp16Q9WTR0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp16Q9WTR0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp16Q9WTR0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp16Q9WTR0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp16Q9WTR0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp16Q9WTR0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp16Q9WTR0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Mmp16Q9WTR0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp16Q9WTR0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp16Q9WTR0 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp16Q9WTR0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp16Q9WTR0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp16Q9WTR0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp16Q9WTR0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp16Q9WTR0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Mmp16Q9WTR0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp16Q9WTR0 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Mmp16Q9WTR0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp16Q9WTR0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp16Q9WTR0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp16Q9WTR0 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp16Q9WTR0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp16Q9WTR0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp16Q9WTR0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp16Q9WTR0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp16Q9WTR0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp16Q9WTR0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mmp16Q9WTR0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mmp16Q9WTR0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mmp16Q9WTR0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp16Q9WTR0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp16Q9WTR0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Mmp16Q9WTR0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp16Q9WTR0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp16Q9WTR0 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp16Q9WTR0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp16Q9WTR0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp16Q9WTR0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Mmp16Q9WTR0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp16Q9WTR0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp16Q9WTR0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Mmp16Q9WTR0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp16Q9WTR0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Mmp16Q9WTR0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp16Q9WTR0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Mmp16Q9WTR0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Mmp16Q9WTR0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp16Q9WTR0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp16Q9WTR0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp16Q9WTR0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp16Q9WTR0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp16Q9WTR0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Mmp16Q9WTR0 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp16Q9WTR0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp16Q9WTR0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp16Q9WTR0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp16Q9WTR0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp16Q9WTR0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp16Q9WTR0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp16Q9WTR0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp16Q9WTR0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp16Q9WTR0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp16Q9WTR0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp16Q9WTR0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp16Q9WTR0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp16Q9WTR0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp16Q9WTR0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp16Q9WTR0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp16Q9WTR0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp16Q9WTR0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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