Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms