Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PplQ9R269 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PplQ9R269 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PplQ9R269 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PplQ9R269 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PplQ9R269 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PplQ9R269 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PplQ9R269 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PplQ9R269 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PplQ9R269 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PplQ9R269 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PplQ9R269 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PplQ9R269 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PplQ9R269 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PplQ9R269 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PplQ9R269 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms