Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms