Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubd1Q9R1K7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms