Protein–RNA interactions for Protein: Q9R118

Htra1, Serine protease HTRA1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra1Q9R118 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms