Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed2Q9R0Q3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed2Q9R0Q3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed2Q9R0Q3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed2Q9R0Q3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed2Q9R0Q3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed2Q9R0Q3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed2Q9R0Q3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed2Q9R0Q3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed2Q9R0Q3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed2Q9R0Q3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed2Q9R0Q3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed2Q9R0Q3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed2Q9R0Q3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed2Q9R0Q3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed2Q9R0Q3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed2Q9R0Q3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed2Q9R0Q3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed2Q9R0Q3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed2Q9R0Q3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed2Q9R0Q3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed2Q9R0Q3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed2Q9R0Q3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed2Q9R0Q3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed2Q9R0Q3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed2Q9R0Q3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed2Q9R0Q3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed2Q9R0Q3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed2Q9R0Q3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed2Q9R0Q3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed2Q9R0Q3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed2Q9R0Q3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed2Q9R0Q3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed2Q9R0Q3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed2Q9R0Q3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed2Q9R0Q3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed2Q9R0Q3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed2Q9R0Q3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed2Q9R0Q3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed2Q9R0Q3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed2Q9R0Q3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmed2Q9R0Q3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmed2Q9R0Q3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms