Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms