Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lamc3Q9R0B6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Lamc3Q9R0B6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Lamc3Q9R0B6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Lamc3Q9R0B6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Lamc3Q9R0B6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Lamc3Q9R0B6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Lamc3Q9R0B6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Lamc3Q9R0B6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lamc3Q9R0B6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lamc3Q9R0B6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lamc3Q9R0B6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lamc3Q9R0B6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lamc3Q9R0B6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Lamc3Q9R0B6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Lamc3Q9R0B6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Lamc3Q9R0B6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lamc3Q9R0B6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lamc3Q9R0B6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lamc3Q9R0B6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lamc3Q9R0B6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lamc3Q9R0B6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lamc3Q9R0B6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lamc3Q9R0B6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lamc3Q9R0B6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lamc3Q9R0B6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lamc3Q9R0B6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lamc3Q9R0B6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lamc3Q9R0B6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lamc3Q9R0B6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lamc3Q9R0B6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lamc3Q9R0B6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Lamc3Q9R0B6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Lamc3Q9R0B6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lamc3Q9R0B6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lamc3Q9R0B6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lamc3Q9R0B6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lamc3Q9R0B6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lamc3Q9R0B6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lamc3Q9R0B6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lamc3Q9R0B6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lamc3Q9R0B6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lamc3Q9R0B6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lamc3Q9R0B6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lamc3Q9R0B6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lamc3Q9R0B6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lamc3Q9R0B6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lamc3Q9R0B6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lamc3Q9R0B6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms