Protein–RNA interactions for Protein: Q9R060

Nubp1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, mousemouse

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp1Q9R060 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nubp1Q9R060 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nubp1Q9R060 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nubp1Q9R060 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nubp1Q9R060 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nubp1Q9R060 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nubp1Q9R060 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nubp1Q9R060 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nubp1Q9R060 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nubp1Q9R060 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nubp1Q9R060 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nubp1Q9R060 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nubp1Q9R060 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nubp1Q9R060 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nubp1Q9R060 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nubp1Q9R060 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nubp1Q9R060 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nubp1Q9R060 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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