Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AmfrQ9R049 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AmfrQ9R049 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms