Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CtsjQ9R014 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms