Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms