Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms