Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChmlQ9QZD5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms