Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr4a3Q9QZB6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr4a3Q9QZB6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nr4a3Q9QZB6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr4a3Q9QZB6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr4a3Q9QZB6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr4a3Q9QZB6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr4a3Q9QZB6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr4a3Q9QZB6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr4a3Q9QZB6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr4a3Q9QZB6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr4a3Q9QZB6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr4a3Q9QZB6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr4a3Q9QZB6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr4a3Q9QZB6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr4a3Q9QZB6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr4a3Q9QZB6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr4a3Q9QZB6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr4a3Q9QZB6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr4a3Q9QZB6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr4a3Q9QZB6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr4a3Q9QZB6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr4a3Q9QZB6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms