Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps29Q9QZ88 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 279 ms