Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubxn8Q9QZ49 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms