Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnnt3Q9QZ47 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnt3Q9QZ47 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms