Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ25

Vnn3, Vascular non-inflammatory molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vnn3Q9QZ25 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vnn3Q9QZ25 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vnn3Q9QZ25 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vnn3Q9QZ25 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vnn3Q9QZ25 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vnn3Q9QZ25 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vnn3Q9QZ25 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vnn3Q9QZ25 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vnn3Q9QZ25 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vnn3Q9QZ25 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vnn3Q9QZ25 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vnn3Q9QZ25 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vnn3Q9QZ25 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vnn3Q9QZ25 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vnn3Q9QZ25 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vnn3Q9QZ25 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vnn3Q9QZ25 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vnn3Q9QZ25 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vnn3Q9QZ25 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vnn3Q9QZ25 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vnn3Q9QZ25 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vnn3Q9QZ25 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vnn3Q9QZ25 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vnn3Q9QZ25 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vnn3Q9QZ25 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vnn3Q9QZ25 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vnn3Q9QZ25 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vnn3Q9QZ25 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Vnn3Q9QZ25 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vnn3Q9QZ25 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vnn3Q9QZ25 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vnn3Q9QZ25 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vnn3Q9QZ25 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vnn3Q9QZ25 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vnn3Q9QZ25 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vnn3Q9QZ25 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vnn3Q9QZ25 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vnn3Q9QZ25 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vnn3Q9QZ25 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vnn3Q9QZ25 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms