Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Foxe3Q9QY14 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Foxe3Q9QY14 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxe3Q9QY14 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxe3Q9QY14 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxe3Q9QY14 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxe3Q9QY14 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxe3Q9QY14 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxe3Q9QY14 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxe3Q9QY14 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxe3Q9QY14 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxe3Q9QY14 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxe3Q9QY14 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxe3Q9QY14 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxe3Q9QY14 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxe3Q9QY14 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxe3Q9QY14 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxe3Q9QY14 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxe3Q9QY14 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxe3Q9QY14 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxe3Q9QY14 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxe3Q9QY14 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxe3Q9QY14 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxe3Q9QY14 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxe3Q9QY14 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxe3Q9QY14 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxe3Q9QY14 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxe3Q9QY14 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxe3Q9QY14 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxe3Q9QY14 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxe3Q9QY14 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxe3Q9QY14 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxe3Q9QY14 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxe3Q9QY14 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxe3Q9QY14 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxe3Q9QY14 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxe3Q9QY14 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxe3Q9QY14 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxe3Q9QY14 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxe3Q9QY14 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxe3Q9QY14 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxe3Q9QY14 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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