Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms