Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms