Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pcsk1nQ9QXV0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms