Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms