Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcea2Q9QVN7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tcea2Q9QVN7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Tcea2Q9QVN7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tcea2Q9QVN7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tcea2Q9QVN7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcea2Q9QVN7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcea2Q9QVN7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcea2Q9QVN7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcea2Q9QVN7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcea2Q9QVN7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms