Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc2lQ9JME7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc2lQ9JME7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc2lQ9JME7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc2lQ9JME7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc2lQ9JME7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc2lQ9JME7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc2lQ9JME7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc2lQ9JME7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc2lQ9JME7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc2lQ9JME7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc2lQ9JME7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc2lQ9JME7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc2lQ9JME7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc2lQ9JME7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc2lQ9JME7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc2lQ9JME7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc2lQ9JME7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc2lQ9JME7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc2lQ9JME7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc2lQ9JME7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc2lQ9JME7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc2lQ9JME7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc2lQ9JME7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc2lQ9JME7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc2lQ9JME7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc2lQ9JME7 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc2lQ9JME7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc2lQ9JME7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc2lQ9JME7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc2lQ9JME7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc2lQ9JME7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc2lQ9JME7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc2lQ9JME7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc2lQ9JME7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc2lQ9JME7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc2lQ9JME7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc2lQ9JME7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc2lQ9JME7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc2lQ9JME7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc2lQ9JME7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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