Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sfmbt1Q9JMD1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfmbt1Q9JMD1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms