Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrfQ9JM73 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms