Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM61

Thsd1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 851 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd1Q9JM61 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Thsd1Q9JM61 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thsd1Q9JM61 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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