Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf19Q9JLL3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms