Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2l2Q9JLG4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms