Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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SacsQ9JLC8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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SacsQ9JLC8 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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SacsQ9JLC8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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SacsQ9JLC8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
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SacsQ9JLC8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SacsQ9JLC8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
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