Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FancaQ9JL70 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FancaQ9JL70 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FancaQ9JL70 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FancaQ9JL70 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FancaQ9JL70 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FancaQ9JL70 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FancaQ9JL70 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FancaQ9JL70 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FancaQ9JL70 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FancaQ9JL70 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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FancaQ9JL70 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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FancaQ9JL70 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FancaQ9JL70 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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FancaQ9JL70 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FancaQ9JL70 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FancaQ9JL70 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FancaQ9JL70 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FancaQ9JL70 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FancaQ9JL70 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FancaQ9JL70 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FancaQ9JL70 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FancaQ9JL70 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FancaQ9JL70 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FancaQ9JL70 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FancaQ9JL70 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
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FancaQ9JL70 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FancaQ9JL70 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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FancaQ9JL70 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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FancaQ9JL70 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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FancaQ9JL70 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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FancaQ9JL70 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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FancaQ9JL70 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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FancaQ9JL70 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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FancaQ9JL70 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FancaQ9JL70 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms