Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL21

Ccr10, C-C chemokine receptor type 10, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr10Q9JL21 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccr10Q9JL21 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms