Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms