Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scamp4Q9JKV5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms